Em São Paulo, choveu forte durante quase toda a manhã e em parte da tarde em algumas regiões. A chuva causou o transbordamento dos rios Pinheiros e Tietê e parou o trânsito em vários pontos. A última vez que chuvas fortes provocaram o transbordamento do Tietê havia sido quatro anos atrás, em 25 de maio de 2005.

As marginais saíram do estado de alerta somente após cerca de seis horas, segundo o Centro de Gerenciamento de Emergências da prefeitura (CGE). A CET (Companhia de Engenharia de Tráfego), que registrou ao longo de todo o dia congestionamentos acima da média na capital paulista, cancelou o rodízio municipal que impediria nesta terça a circulação de veículos com placas de final 3 e 4 entre 17h e 20h no centro expandido. A cidade de São Paulo nunca registrou tanto volume de chuva em setembro em apenas um dia desde 1943, quando o Inmet (Instituto Nacional de Meteorologia) começou a medir a precipitação.